三個月寶寶大便有粘液可能是乳糖不耐受、胃腸道功能紊亂、腸道感染所致，需結合病因采取治療方案。

一、乳糖不耐受：母乳和牛乳中的主要糖類是乳糖，若缺乏分解乳糖的酶，就可能出現大便有粘液的情況。可到正規醫院檢查就診，若確定是乳糖酶缺乏，可服用乳糖酶進行治療。

二、胃腸道功能紊亂：

1.若寶寶大便粘液量不多，且無惡心、嘔吐、腹脹等情況，可能是胃腸道功能紊亂。通常不需要特殊治療，調整飲食后癥狀可能會好轉。

三、腸道感染：

1.當寶寶大便粘液較多或大便次數增多，并伴有腹瀉等情況時，需高度警惕，可能是腸道感染。建議及時到正規醫院就診。

2.若確診是腸道感染導致的，可配合醫生服用抗感染藥物進行治療。

三個月寶寶大便出現粘液的原因多樣，應根據具體情況判斷，必要時就醫檢查并采取針對性治療措施。