懷孕40天是可以進行藥物流產的，但無法確保能完全流干凈，需依據具體情況判斷。臨床上，藥物流產雖痛苦較小且對身體傷害相對也小，然而其成功率約為80%，存在流產不全的可能。屆時女性可能出現長時間陰道流血，甚至常伴有下腹部劇烈疼痛，此時就需進行清宮手術。

一、女性若打算流產，建議務必前往正規醫院咨詢專業醫生。首先要進行相關檢查：

1.排除宮外孕的可能；

2.查看自身是否適合藥物流產，以免引發不必要麻煩。

二、此外，懷孕40天女性也可選擇人工流產，如常見的無痛人流手術：

1.這種方式不會有明顯疼痛感，比較安全；

2.流產不全的發生率相對較低。

總之，懷孕40天選擇流產方式需謹慎考慮，要在正規醫院經過詳細檢查和專業醫生指導后再做決定，以保障自身健康和安全。