化濕和胃
石菖蒲辛苦氣香，入胃經則能宣化濕濁、開胃消食，乃化濕和胃良藥。
《本草備要》謂其“去濕逐風，脘痞不饑者，癥見：胃脘脹滿悶痛、飲食無味、食欲不振、形瘦體倦、苔膩脈細等，用之多效。
皆取其苦燥除濕、辛香宣散、利竅開胃、消積寬中之功也。
散寒除痹
石菖蒲芳香辛溫，溫可勝寒，辛香散濕;更走中焦、則可開發脾胃之氣雨除風寒濕痹。
正如《本草求真》謂：“《本經》首言治風寒濕痹，是取其辛溫開發脾氣之力。”本品既“主的肢濕痹，不得屈伸”(《名醫別錄》)，亦治邪風冷痹、身體俱痛，如(《圣濟總錄》菖蒲散)，以本品配烏頭等，治冷痹身痛。
去濕止癢
石菖蒲辛苦而溫，辛溫能化濕，苦燥可殺蟲，故本品外用涂敷，有去濕療瘡、殺蟲止癢之功。
《藥性論》亦載，本晶“殺諸蟲，治惡瘡疥瘙。”對皮膚濕瘡、疥癬等疾，皆可應用。
如《濟急仙方》以菖蒲配蛇床子組方、為末涂搽，主治：陰汗濕癢。
開竅寧神
用于濕濁蒙蔽清竅之神志昏亂及健忘、耳鳴、耳聾。本品芳香開竅、寧心安神，兼有化濕、豁痰、辟穢之功。本品單用或配伍平肝、安神藥同用，又可治癲狂、癡呆等證。
抗驚厥
本品所含其β-細辛醚有抗驚厥作用。
改善記憶
其水煎醇沉液具有增智、促進記憶獲得、改善記憶障礙的作用。
