扁平疣可以通過外用藥物、物理治療、光動力治療、系統治療等多種方法清除，治療方法的選擇應根據個體情況在醫生指導下進行，同時注意避免搔抓疣體以防擴散。

1.外用藥物

包括維A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，這些藥物可以促進扁平疣消退。

2.物理治療

如冷凍治療、激光治療、電灼治療等，適用于疣體數量較少、面積較小的情況。

3.光動力治療

對于難治性扁平疣或疣體位于特殊部位的患者，光動力治療可能是一種選擇。

4.系統治療

對于疣體較多或病情頑固的患者，口服藥物如抗病毒藥物、免疫調節劑等可能會被使用。

需要注意的是，扁平疣的治療方法應根據個體情況選擇，在醫生的指導下進行。同時，扁平疣具有傳染性，治療期間應避免搔抓疣體，以免擴散。對于特殊人群，如孕婦、兒童等，治療方法的選擇需要更加謹慎。如果對扁平疣的治療有任何疑問，建議咨詢皮膚科醫生。