膝蓋上方肌肉酸疼的原因包括：

一、軟組織損傷。這通常與長距離行走或劇烈的跑跳運動等相關。當進行這些運動后，可能使肌肉軟組織處于疲勞狀態并受到損害，進而導致膝蓋上方肌肉出現疼痛、酸脹感。對此，可以在醫生指導下外用消炎止痛膏、消瘀定痛膏等進行治療。

二、軟組織炎癥。該部位出現炎癥時會引起膝蓋上方肌肉酸疼，同時還可能伴有局部紅腫熱痛等表現。這種情況下，患者可遵循醫囑服用阿莫西林、氧氟沙星等進行抗感染治療。

三、痛風。痛風是由單鈉尿酸鹽晶體引發的炎癥性疾病，發作時也可能有膝蓋上方肌肉酸疼的癥狀。針對此，患者可按照醫囑服用吲哚美辛、依托考昔等進行相關治療。

以上內容僅供參考，若出現相關癥狀，建議及時前往醫院，在醫生的指導下進行規范診治。