半飛秒與全飛秒激光手術都屬于板層角膜激光手術，它們有共同之處，即術后恢復都比較快，但各自也有優缺點。

全飛秒手術切口僅為2mm大小，而半飛秒手術切口則有20mm大小，是全飛秒手術切口的10倍。

半飛秒手術切斷的神經比全飛秒手術多，因此術后發生干眼的時間以及干眼的頻率要高于全飛秒手術患者。

半飛秒又被稱為瓣飛秒，存在瓣移位、瓣皺褶的風險，而全飛秒不存在這類風險，且術后生物力學穩定性要好于半飛秒手術。不過半飛秒的優勢在于進行第二次增效手術時，可以通過角膜地形圖、角膜波前像差來引導手術，能更加節省角膜。