眨眼睛時感到疼痛，可能是由多種原因導致的，包括用眼過度、眼部感染、炎癥等，以下是一些可能的原因：

1.用眼過度

長時間看電子產品或書籍，使眼部未得到適當休息，可能導致眼睛疲勞和疼痛。此時，可以通過按摩、熱敷眼部來緩解疼痛，同時要注意避免長時間用眼，多休息。

2.干眼癥

經常熬夜或長時間看手機電腦，可能導致淚液分泌不足或淚液成分異常，引起眼部不適、干澀感和疼痛。在醫生的指導下，可以使用玻璃酸鈉滴眼液等藥物治療。

3.結膜炎

由細菌或病毒感染引起的結膜炎癥，表現為眼睛紅腫、眼癢、疼痛等癥狀。可在醫生指導下使用青霉素v鉀片、氯霉素滴眼液等藥物治療。

4.角膜炎

通常由微生物感染、外傷及理化刺激等因素引起，表現為眼痛、畏光、流淚、眼瞼痙攣等癥狀。患者可以在醫生指導下使用氧氟沙星滴眼液、紅霉素片等藥物進行治療。

5.麥粒腫

是睫毛毛囊附近的皮脂腺或瞼板腺的急性化膿性炎癥，通常與病菌感染有關，也可能導致眼部疼痛。可遵醫囑使用紅霉素眼膏、鹽酸米諾環素膠囊等藥物治療。

總之，眨眼睛痛的原因可能有很多，建議患者及時就醫，在醫生的指導下進行對癥治療。同時，要注意保持眼部衛生，避免用手觸碰眼部，以免加重癥狀。