5羥色胺是由色氨酸衍生而來，主要存在人體的大腦、血小板和胃部等部。具有血管收縮和刺激平滑肌收縮的作用。還可以參與睡眠節律以及體溫的調節，還可以對痛覺的傳遞進行調節。

5羥色胺又稱血清素，它是色氨酸衍生而來的，它廣泛存在于大腦、血小板和胃部等器官組織中。5羥色胺是中樞神經系統一種重要的抑制性神經遞質，它在大腦皮層和神經突觸內的含量是最高的。對于外周組織，5羥色胺具有血管收縮和刺激平滑肌收縮的作用。5羥色胺在大腦中主要分布于松果體和下丘腦，可以參與一些睡眠節律的調節、體溫的調節以及痛覺的傳遞等生理功能的調節。通常在偏頭痛、低氧血癥等患者中5羥色胺會升高，而在結締組織病，風濕免疫系統疾病，比如系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎，或者帕金森病以及肝豆狀核變性等疾病中，患者的5羥色胺水平是降低的。