小兒抽動癥的具體病因還沒有統一的定論，但是很多因素都有可能誘發小兒抽動癥。遺傳是導致抽動癥發病的重要因素，患者可能有家族史。還有產傷、感染、重大的應激、中毒、創傷等原因也會引起抽動癥。

小兒抽動癥的病因非常復雜，它的致病原因是綜合性的因素導致的。常見的病因有遺傳，家族成員中患抽動癥的較多見。還有先天發育異常，可能是孕婦服用了精神類藥物。還有家庭的因素，可能是父母神經質影響小孩的情緒。