二、皮膚和粘膜：皮疹常見，約40%患者有面部典型紅斑稱為蝶形紅斑。急性期有水腫、色鮮紅，略有毛細血管擴張及鱗片狀脫屑，嚴重者出現水皰、潰瘍、皮膚萎縮和色素沉著。手掌大小魚際、指端及指甲周紅斑，身體皮膚暴露部位有斑丘疹、紫斑等。出現各種皮膚損害者約占總患病數的80%，毛發易斷裂，可有斑禿，系統性紅斑狼瘡壽命正常。
三、關節、肌肉：約90%以上患者有關節腫痛，且往往是就診的首發癥狀，易受累的是手近端指間關節，膝、足、髁、腕關節均可累及。關節腫痛多呈對稱性。 約半數患者有晨僵。X線檢查常無明顯改變，僅少數患者有關節畸形。肌肉酸痛、無力是常見癥狀。
四、腎臟：約50%患者有腎臟疾病臨床表現，如蛋白尿、血尿、管型尿、白細胞尿、低比重尿、浮腫、血壓增高、血尿素氮和肌酐增高等。
五、心臟。
六、肺：肺和胸膜受累約占50%，其中約10%患狼瘡性肺炎，胸膜炎和胸腔積液較常見。
七、神經系統：神經系統損害約占20%，一旦出現，多提示病情危重，大腦損害可出現精神障礙，如興奮、行為異常、抑郁、幻覺、強迫觀念、精神錯亂等。
八、血液系統：幾乎全部患者在某一階段發生一項或幾項血液系統異常，依次有貧血、白細胞減少、血小板減少、血中抗凝物質引起出血現象等，貧血的發生率約80%，正細胞正色素或輕度低色素性。
