一、患者對強直性脊柱炎治療的恒心不夠：
本身疾病就屬于一種難治的疾病，倘若患者在治療疾病期間，沒有足夠的信心與恒心，導致治療的期限不足，或是往往采取一些方法見效都是比較慢的。但是患者不能堅持治療，只要一段時間治療不見效果，便對治療喪失信心進而終止治療。同時患者由于懼怕疼痛不進行有效的關節功能鍛煉，導致關節很快強直，無法繼續治療。
二、對病因的研究不夠明確：
這也是導致強直性脊柱炎治療難的一大原因。因為該種疾病的發病原因不僅較繁多，而且還比較復雜，并且還具有明顯的家族遺傳傾向，強直性脊柱炎還有明顯的種族遺傳傾向，但是引起發病又與自身免疫功能在某個階段出現低下有密切關系，同時與體內局部感染有關，還涉及環境因素。強直性脊柱炎是一個多臟器、多系統疾病，它涉及遺傳學、免疫學、內科學、骨科學，為多學科疾病，所以治療起來比較難。
三、治療方法有限：
根據目前的醫學水平，對強直性脊柱炎的治療僅局限于骨科疾病的治療上，雖說從疾病的表面來看，的確是因為一些關節的病變而造成患者關節強直的，但是實際上強直性脊柱炎又是一個地地道道的免疫學科疾病，累及多個臟器同時患病。手術抗原解決關節骨橋強直問題，但是解決不了術后骨橋繼續形成問題，手術治療往往以失敗告終。免疫學治療又難以解決肌腱末端炎癥問題，骨橋繼續形成病情難以控制。強直性脊柱炎的治療難在哪兒呢。