子宮內膜異位癥是激素依賴性疾病，因此主要見于育齡婦女。近年來，其發病率越來越高，已成為婦科常見病。育齡婦女中的發病率約為10%,然而，由于它與不孕和盆腔痛的關系，在這些女性人群中，其患病率明顯要高。據報道，其患病率不孕癥婦女為25%-35%，盆腔痛的婦女達39-59%。而內異癥患者50%的病人有明顯的痛經，30%合并不孕，嚴重地影響中青年婦女的健康和生活質量。
異位子宮內膜可出現在身體不同部位，但絕大多數位于盆腔內，其中盆腔腹膜內異癥約占75%;卵巢受累達半數以上，兩側卵巢同時波及者約50%;約7%～37%累及腸管;16% 累及泌尿系。盆腔外內異癥常見于剖宮產和側切手術的瘢痕處，罕見于臍、肺、肌肉骨骼、胃、肝臟、眼和腦等處。郎景和將內異癥可分為腹膜型、卵巢型、深部浸潤型和其他部位型四個類型[4]。日本學者根據內異癥病灶形態，在腹腔鏡下可分為無色素性病灶，含色素性病灶和繼發性病變等。無色素性病灶包括透明小水泡、漿液性囊泡和表面隆起等。含色素性病灶包括紫藍色結節、血性囊泡、散在煤渣樣灶、含鐵血紅素著色、點狀出血斑、漿膜下出血等。
顯微鏡下檢查早期子宮內膜異位病灶，在病灶中可見到子宮內膜上皮、內膜腺體或腺樣結構、內膜間質及出血。有時臨床表現典型，但內異癥的組織病理特征極少,鏡檢時能找到少量內膜間質細胞即可確診。異位子宮內膜可出現不典型增生，少數發生惡變，多為卵巢子宮內膜樣癌或透明細胞癌。
子宮內膜異位癥引起的不孕是錯綜復雜的，它不可能是某一個單一原因造成的，而是多個機制疊加作用的結果，并隨著個體差異的不同，表現出作用機制的不同。總的來說，EM的不孕程度與其疾病的嚴重性有一定的相關性。而助孕技術在EM患者中的成功率顯著低于患有輸卵管疾病的婦女，而且重度EM患者的預后明顯不如輕度患者。
由于很多原因，子宮內膜異位癥的疼痛機制還很難確定。
不過，目前認為有三大機制
1、腹腔中炎癥因子的作用;
2、異位種植病灶出血的直接或間接影響;
3、盆底神經的受累或侵潤。