以往多數患者對治療效果不滿意，許多醫生在醫治前列腺炎過程中感到很棘手，甚至認為很多患者將不得不終生忍受疾病帶來的痛苦。盡管如此，如果能夠詳細詢問病史、詳加檢查、準確分型，對不同類型的前列腺炎患者采用個體化的治療策略，仍有可能使絕大多數患者取得滿意的治療效果。 對前列腺炎，尤其是慢性前列腺炎的治療仍然有許多問題沒有澄清。許多醫生都體會到選擇敏感的抗生素是治療前列腺炎必要手段，尤其是藥物的局部治療。但是單純使用抗生素常不能獲得滿意效果，尤其是對反復多次復發的慢性前列腺炎患者效果更差，即使是對肯定存在感染因素的細菌性前列腺炎也是如此。
應用解除肌肉痙攣的藥物或方法，例如α-腎上腺素能受體(α-AR)阻滯劑、β受體阻滯劑、平滑肌松弛劑、生物反饋方法、植物藥療法等，常可較好地緩解局部疼痛和排尿異常癥狀。還應該重視綜合治療措施，強調精神心理治療、矯治神經衰弱和對前列腺疾病相關知識的普及。
單一的治療方法往往造成治療周期延長、多數治療失敗、患者的自信心和對醫生的信任度下降，所以一般都同時選擇多種療法的綜合治療措施，從不同的角度，根據不同的發病環節進行針對性治療。在治療過程中還要不斷地復查和定期隨訪，根據患者的病情變化采取相應的措施。預先告知患者本病的預后，使其能夠對自身疾病及其轉歸有一個清醒的認識。如何保護前列腺是前列腺炎患者在治療過程中和疾病治愈后始終要注意的重要問題，盡量避免一切對前列腺有害的因素可以幫助前列腺炎患者康復，并防止復發或再感染。
目前，臨床上治療前列腺炎的方法選擇和藥物選擇很多，還沒有哪一種方法或藥物可以明顯有效地適用于所有的前列腺炎患者，使得醫生在治療選擇時十分困難或無從選擇。即使醫生十分肯定前列腺炎患者的病因，例如免疫性異常、神經肌肉緊張等，也不能治愈所有的患者或使患者的所有的臨床癥狀完全消失。深入研究前列腺炎的病因和病理生理，可望選擇出針對不同病因或不同類型前列腺炎更加有效的治療方法，制定出詳細全面的治療規范，治療前列腺炎的混亂狀態才會徹底得以糾正。