由于哮喘的臨床表現并非哮喘特有，所以在建立診斷的同時，需要除外其他疾病所引起的喘息、胸悶和咳嗽。
1.心源性哮喘 心源性哮喘常見于左心衰竭，發作時的癥狀與哮喘相似，但心源性哮喘多有風濕性心臟病和先天性心臟病等病史和體征。陣發咳嗽，常咳出粉紅色泡沫痰，兩肺可聞廣泛的水泡音和哮鳴音，左心界擴大，心率增快，心尖部可聞奔馬律。胸部X線檢查時，可見心臟增大，肺淤血征，心臟B超和心功能檢查有助于鑒別。若一時難以鑒別可霧化吸入選擇性β2 受體激動藥或注射小劑量氨茶堿緩解癥狀后進一步檢查，忌用腎上腺素或嗎啡，以免造成危險。
2.肺結核 可表現為反復咳嗽、咳痰、氣促等，如氣道內膜結核可出現明顯氣喘，需與支氣管哮喘鑒別。主要鑒別點為：TB接觸史;TB慢性中毒癥狀;PPD試驗陽性;支氣管激發試驗陰性或PEF變異率<15%;痰涂片找到抗酸桿菌，痰TB-PCR陽性，胸片、胸部CT檢查，必要時作纖支鏡檢查可明確診斷。
3.毛細支氣管炎 多為呼吸道合胞病毒引起，多見于3歲以下尤其6個月以下嬰幼兒。既往無反復發作史，本次起病急，先有上呼吸道感染癥狀，逐漸出現喘憋、呼氣性呼吸困難。主要體征：呼氣延長，呼氣相喘鳴音及細濕?音。胸片：彌漫性肺氣腫及斑片狀陰影。吸入β2受體激動藥及全身使用激素療效不確切。病毒病原學檢測可確診。
4.肺炎支原體肺炎 由肺炎支原體引起的肺部炎癥，主要臨床表現為刺激性干咳，一般沒有明顯呼吸困難，癥狀可延續2～3個月，主要與CVA鑒別。主要鑒別點：既往無反復咳嗽、氣喘病史，本次常以鼻塞、流涕、發熱、咳嗽等呼吸道感染癥狀起病，然后咳嗽遷延不愈。胸片可見斑片狀或云霧狀陰影，可為游走性。冷凝集試驗≥1/64陽性或肺炎支原體抗體陽性。大環內酯類抗生素治療有效。
5.氣道異物 既往無反復咳喘史，本次發病前常有進食過程中嗆咳或明確異物吸入史，體檢常有呼吸音不對稱，病側呼吸音減弱、觸覺語顫減弱和局部哮鳴音等體征。胸片、胸部CT可協助診斷。纖支鏡檢查可明確診斷并同時作異物取出術。
6.胃-食管反流(GOR) GOR是由于胃內容物反流入食管使食管下端的感受器受到刺激而引起發作性或持續性咳嗽，GOR可以是慢性咳嗽的唯一或主要原因。病人可有反流癥狀如胃灼熱、上腹飽脹感等，但75%病人可無典型反流表現，僅表現為慢性咳嗽，支氣管激發試驗陰性或PEF變異率<15%，抗哮喘治療效果不佳。24h食管pH值監測顯示食管電極的Demeester積分≥14.72，反流與咳嗽的癥狀相關概率(symptom associated probability)≥95%，抗反流治療有效可助診斷。
7.鼻后滴漏綜合征(PNDs) 可表現為發作性或持續性咳嗽，是慢性咳嗽的常見原因之一，應與CVA鑒別。PNDs常有鼻炎、鼻竇炎的病史，有鼻后滴流和(或)咽后壁黏液附著感，檢查發現咽后壁有黏液附著、鵝卵石樣觀，鼻竇炎者鼻竇片或鼻竇CT可見鼻竇黏膜增厚>6mm或竇腔模糊不清或有液平，經治療(如鼻吸入糖皮質激素、鼻血管收縮劑、鼻竇炎加用抗生素)后咳嗽癥狀緩解。
8.嗜酸性粒細胞性支氣管炎(EB) 目前有關EB是單獨的疾病還是哮喘的早期表現尚未明確，其主要臨床表現為慢性咳嗽，胸部X線檢查無特殊發現，肺通氣功能檢查正常，支氣管激發試驗陰性，PEF變異率正常。誘導痰中嗜酸性粒細胞>3%，口服或吸入皮質激素治療有效可助診斷。
9.過敏性肺泡炎 是由于吸入有機粉塵等變應原所致的肺肉芽腫性炎癥性疾病，可表現為反復發作的咳嗽、呼吸困難等，胸部X線檢查無特異性，主要表現為雙下肺浸潤性改變，肺彌散功能下降，支氣管激發試驗或舒張試驗陰性，PEF變異率正常，無嗜酸性粒細胞及IgE增加。特殊環境或職業接觸史，血清中相應變應原特異性抗體陽性可助診斷。
10.彌漫性細支氣管炎 是一種主要累及呼吸性細支氣管的彌漫性疾病，可由于吸入性損傷(有毒氣體、煙霧、礦物質微粒等)、感染、藥物等引起，部分病人為特發性。臨床上表現為咳嗽、咳痰、喘息、氣促，癥狀常較持續，雙肺廣泛哮鳴音及捻發音。支氣管擴張試驗陰性或PEF變異率<15%，平喘治療效果不確切。
11.癔癥(歇斯底里) 是大腦皮質暫時性功能失調所致的一種功能性疾病。常具有“歇斯底里”性格(情感強烈多變、自我中心、表現欲強烈、幻想力豐富、言行舉止夸張往往具有戲劇色彩)，女性多見。臨床表現多樣，包括精神和(或)軀體方面癥狀，突發突止，可表現為發作性“氣促”或“氣喘”常于受精神刺激后發病，家人的過分關心或過度緊張可使癥狀誘發或加重，發作時肺部無異常體征，胸片等檢查無異常，支氣管激發試驗陰性或PEF變異率<15%，可經暗示治療緩解。
12.支氣管擴張癥 在有繼發感染時，支氣管擴張處分泌物增加及堵塞也可出現哮喘樣呼吸困難及聽到哮鳴音。一般可根據既往嚴重肺部感染，反復肺不張及咯出大量膿笥痰液的病史予以鑒別，必要時胸部X線片及支氣管造影或CT檢查可以診斷。