任何疾病都有出現誤診的可能，其中，小兒抽動癥誤診情況也并不少見。有可能是醫生對此病不熟悉，也有可能是家長對此病不認同，還有可能因患兒自控而病狀被掩蓋以致不易察覺，這些都會有最終導致誤診的可能。作為孩子的家長不能不對此警覺。
首先，可能是醫生對此病不熟悉。醫生對小兒抽動癥的認識不夠，以致于往往很容易被多種多樣的癥狀所迷惑而出現誤診。
比如將皺眉、眨眼誤診為眼結膜炎;將喉肌抽動所導致的干咳誤診為氣管炎、慢性咽炎;將動鼻誤診為慢性鼻炎等。
其次，家長對此病不認同。很多家長都以為不停地聳肩、眨眼等只是孩子的不良習慣，強制之后就會好轉。
就是因此而就診時，也多不配合醫生的詢問，而以“沒事，孩子的壞毛病，會改好的”之類的話搪塞，從而錯過就診的最佳時機。
最后，因患兒自控而病狀被掩蓋以致不易察覺。患兒可以對癥狀產生有一定層度上的控制能力，這樣使得家長和醫生不易覺察。
小兒抽動癥誤診情況中還有一種是因為某些醫生認為抽動-穢語綜合癥必須具備穢語，其實只有三分之一的患者發病幾年后才表現出穢語。
小兒抽動癥誤診情況并不是沒有，所以一定要對自己的孩子負責，仔細詢問相關知識，并在對孩子的行為觀察時有耐心，以免孩子的病情被延誤而不能及時治療，最終導致孩子受到身心雙重的傷害。