嬰兒生后即開始便秘，應注意與以下病癥相鑒別。
一、甲狀腺功能不全
1、簡介
甲狀腺功能低下(hypothyroidism)是甲狀腺素分泌缺乏或不足而出現的綜合征。
2、鑒別要點
多于出生后數周出現癥狀，表現有皮膚蒼白、增厚、多褶皺鱗屑，口唇厚、大且常外伸、口常張開流涎，外貌丑陋，面色蒼白或呈蠟黃，鼻短且上翹、鼻梁塌陷，前額皺紋，身材矮小，四肢粗短、手常呈鏟形，臍疝多見。心率減慢，體溫降低，生長發育低于齡兒童，成年后身材常為矮小。
先天性甲狀腺完全缺如者上述癥狀可在生后1—3個月出現，且表現較重，甲狀腺不。如尚有殘存的腺體組織，則癥狀出現在出生后6個月一2年，且常伴有甲狀腺腫。
二、先天性巨結腸
1、簡介
先天性巨結腸(Hirschsprung′s discase)又稱腸管無神經節細胞癥(Agangliono-sis)。由于hirschsprung將其詳細描述，所以通常稱之為赫爾施普龍病(hirschsprung’s- Disease)，是由于直腸或結腸遠端的腸管持續痙攣，糞便淤滯的近端結腸，使該腸這肥厚、擴張，是小兒常見的先天性腸道畸形。
2、鑒別要點
鋇灌腸檢查除結腸擴張外，可見有節段性狹窄，而慢性便秘則結腸全部擴張。
三、神經性或器質性梗阻
1、簡介
神經性腸梗阻(Neurosis Intestinal Obstruction)也稱痙攣性腸梗阻，功能性腸梗阻，動力性腸梗阻，謝爾舍米斯基病，本征由蘇聯醫師Chercherski首先描述故又稱Chercnerski病。我國也有少數病例報道，實際本征并不少見。
2、鑒別要點
對兒童便秘也要進行詳細體檢和必要的輔助檢查以便和神經性或器質性梗阻鑒別。
通過詳細詢問病史和體格檢查，絕大部分診斷不難，在診斷困難時，可行腹部X線透視或攝片檢查，如發現小腸內有氣體和液平面的存在，即為湯內容物通過障礙，提示有腸梗阻的可能，但本病早期可無明顯的腸梗阻的X線征象，應特別警惕，因此本病的診斷主要根據臨床表現，絕不能單靠X線檢查來確定或否定。