對于尖銳濕疣，我們都知道它是一種非常嚴重的性病，其傳染速度較快。所以很多人提起尖銳濕疣就很是恐慌，其實如果你有一些不適，也不一定就能說明患了尖銳濕疣，說不定只是身體出現了炎癥。所以說，做好尖銳濕疣的鑒別診斷非常關鍵。
1、生殖器部位癌癥的表現其邊界不清晰，癌變可能有明顯的浸潤現象，經常會形成潰瘍，有時需要進行病理組織學檢查。
2、扁平濕疣一般是二期的皮疹。扁平濕疣的基底寬，無蒂，外觀扁平，疣面潮濕、光滑。在暗視野顯微鏡檢查下可找到梅毒螺旋體，而梅毒的血清反應呈現陽性。
3、假性濕疣，此種濕疣又可被稱為女性絨毛狀小陰唇，在女性的小陰唇上可能會出現魚卵狀、排列規則的增生物。
4、生殖器鮑溫樣丘疹病，在本病中較為少見，主要與人類的乳頭瘤病毒的16型感染有關。其癥狀主要表現為生殖器部位多發性棕紅色小丘疹，直徑有2～10mm。臨床上的癥狀很像，但組織學上類似鮑溫病的改變。
5、珍珠樣丘疹病，此種疾病一般多發生在男性的龜頭部位，沿龜頭的冠狀溝有排列整齊、大小一致的珍珠樣丘疹。
尖銳濕疣的鑒別診斷主要需要從以上五種疾病中加以區分，像扁平濕疣、假性濕疣、生殖器鮑溫樣丘疹病及珍珠樣丘疹病等。此種疾病的病因不明，常見于青年男性，這也是尖銳濕疣的鑒別診斷標準之一。