出現肺部感染的原因多為吸入性損傷，氣管切開或插管，誤吸、肺水腫、肺不張、休克、手術麻醉、創面侵襲性感染、化膿性血栓性靜脈炎等。

　　肺部感染病因學分類

　　一、細菌性肺炎如肺炎鏈球菌(即肺炎球菌)、金黃色葡萄球菌、甲型溶血性鏈球菌、肺炎克雷白桿菌、流感嗜血桿菌、銅綠假單胞菌、埃希大腸桿菌、綠膿桿菌等。

　　二、非典型病原體所致的肺炎如軍團菌、支原體和衣原體等。

　　三、病毒性肺炎如冠狀病毒、腺病毒、流感病毒、巨細胞病毒、單純皰疹病毒等。

　　四、真菌性肺炎如白念珠菌、曲霉、放射菌等。

　　五、其它病原體所致的肺炎如立克次體、弓形蟲、原蟲、寄生蟲如肺包蟲、肺吸蟲、肺血吸蟲)等。機體免疫力低下者(如艾滋病患者)容易伴發肺部卡氏肺包子蟲、軍團菌、鳥形分支桿菌、結核菌、弓形體等感染。

　　六、理化因素所致的肺炎如放射性肺炎、胃酸吸入、藥物等引起的化學性肺炎等。

　　七、支原體肺炎由肺炎支氣體引起。

　　細菌性肺炎，病毒性肺炎和非典型性原體所致的肺炎的常見患病原因，多與其外界病毒和免疫功能下降有關。

　　細菌性肺炎

　　主要有感染性和理化性如放射線、毒氣、藥物以及變態反應性如過敏性肺炎等，臨床所見絕大多數為細菌、病毒、衣原體、支原體、立克次體、真菌和寄生蟲等引起的感染性肺炎，其中以細菌最為常見。

　　病毒性肺炎

　　病毒性肺炎為吸入性感染，通過人與人的飛沫傳染，主要是由上呼吸道病毒感染向下蔓延所致，常伴氣管-支氣管炎，其中以流行性感冒病毒為常見，其他為副流感病毒、巨細胞病毒、腺病毒、鼻病毒、冠狀病毒和某些腸道病毒，如柯薩奇、埃可病毒等，以及單純皰疹、水痘-帶狀皰疹、風疹、麻疹等病毒。嬰幼兒還常由呼吸道合胞病毒感染產生肺炎。

　　真菌性肺炎

　　引起原發性真菌性肺炎的大多是皮炎芽生菌，莢膜組織胞漿菌或粗球孢子菌，其次是申克孢子絲菌，隱球菌，曲菌或毛霉菌等菌屬。真菌性肺炎可能是抗菌治療的一種合并癥，尤見于因病情嚴重或接受免疫抑制治療以及患有艾滋病而致防御功能下降的病人。雖然有其他的病原體，但對于免疫功能健全的人來說，是不致病的。

　　非典型病原體所致的肺炎

　　炎支原體、肺炎衣原體和軍團菌被認為是非典型病原體中代表性的致病微生物，都是細胞內病原體。臨床表現較典型大葉性肺炎(肺炎鏈球菌肺炎)癥狀明顯為輕、實變體征甚少的肺炎，這類肺炎的主要病原體是肺炎支原體和肺炎衣原體，而軍團菌肺炎亦因其肺外癥狀顯著而有別于典型肺炎被歸入“非典型肺炎”。軍團菌為G一桿菌，而支原體和衣原體在分類上另成一類，但它們能獨立生活，能在無細胞培養基上生長，以二分裂繁殖，對大環內酯類和喹諾酮類抗生素敏感，因而有人將它們稱為“類細菌”。

　　肺部感染最常見的是肺炎，還包括終末氣道、肺泡腔及肺間質在內的肺實質炎癥，雖然引起肺部感染，導致肺炎發生的病原體有很多，但是每種類型里面都有比較常見的病原體和常見的感染原因。