腦炎后遺癥根據病因病變分布和嚴重程度而有所不同。輕型的病例，可僅有頭痛，頭暈，頸部僵直等，漿液性腦膜炎的癥狀，病變嚴重彌漫時，則可出現意識障礙，譫妄躁動，顱神經麻痹，肢體癱瘓，不自主運動，尿便障礙，驚厥等癥狀。及早的診斷檢查，及早的治療，對患者有很大的幫助。專家對腦炎后遺癥診斷做出了如下介紹：

　　診斷腦炎后遺癥的四種方法

　　1.鉤端螺旋體病：本病的腦膜炎型易與乙腦混淆，但多有疫水接觸史，乏力、腓腸肌痛、結膜充血、腋下或腹股溝淋巴結腫大，腦脊液變化輕微?？捎醚鍖W試驗加以證實。

　　2.流行性腮腺炎、脊髓灰質炎、柯薩奇及埃可病毒等所致中樞神經系統感染。

　　3.中毒型菌?。?/strong>本病亦多見于夏秋季，兒童多發，病初胃腸癥狀出現前即可有高熱及神經癥狀(昏迷、驚厥)，故易與乙腦混淆。但本病早期即有休克，一般無腦膜刺激征，腦脊液無改變，大便或灌腸液可查見紅細胞，膿細胞及吞噬細胞，培養有痢疾桿菌生長，可與乙腦相區別。

　　4.腦型瘧疾：發病季節、地區及臨床表現均與乙腦相似。但腦型瘧疾熱型較不規則。病初先有發冷、發熱及出汗然后出現腦癥狀。還可有脾腫大及貧血。