按粒細胞動力學和病理生理，本癥可分為四類：
(一)骨髓損傷
1.藥物引起的損傷
抗腫瘤藥物和免疫抑制劑都可直接殺傷增殖細胞群，藥物抑制或干擾粒細胞核酸合成，影響細胞代謝，阻礙細胞分裂。藥物直接的毒性作用造成粒細胞減少與藥物劑量相關。其它多類藥物亦可有直接的細胞毒性或通過免疫機制使粒細胞生成減少。
2.化學毒物及放射線
化學物苯及其衍生物、二硝基酚、砷等對造血干細胞有毒性作用，X線和中子能直接損傷造血干細胞和骨髓微環境，造成急性或慢性放射損害，出現粒細胞減少。
3.異常細胞浸潤骨髓
癌腫骨髓轉移、造血系統惡性病及骨髓纖維化等造成骨髓造血功能的衰竭。
4.免疫因素
自身免疫性粒細胞減少是自身抗體、T淋巴細胞或自然殺傷細胞作用于粒系分化的不同階段，致骨髓損傷，粒細胞生成障礙。常見于風濕病和自身免疫性疾病時。
5.全身感染
細菌感染如分支桿菌(特別是結核桿菌)及病毒感染如肝炎病毒等。
6.細胞成熟障礙——無效造血
如葉酸和維生素B12缺乏，影響DNA合成，骨髓造血活躍，但細胞成熟停滯而破壞于骨髓內。某些先天性粒細胞缺乏癥和急性非淋巴細胞白血病、骨髓異常增生綜合癥、陣發性睡眠性血紅蛋白尿也存在著成熟障礙，而致粒細胞減少。
(二)血管外組織內的粒細胞需求增加
(三)周圍循環粒細胞分布異常
(四)混合因素
如慢性特發性粒細胞減少癥、周期性粒細胞減少癥等。臨床上上述三類白細胞減少常混合存在，宜注意分析。