精子生成障礙是引起無精癥的一個重要原因，也是無精癥引起男性不育的原因，精子生成障礙的疾病因素主要有：遺傳性疾病、先天性睪丸異常、睪丸本身病變、內分泌疾病、嚴重全身性疾病和營養不良等。
遺傳性疾病
常染色體或性染色體異常可影響睪丸內精子的生成，如克氏(Klinefelter)綜合征、睪丸女性化綜合征等。遺傳性疾病影響精子發育，造成少精癥或無精癥，使患者喪失生育能力。
先天性睪丸異常
睪丸發育異常或睪丸位置異常均能使精子生成障礙。睪丸發育異常如無睪畸形、隱睪疾、睪丸發育不全;睪丸位置異常如睪丸外傷致移位、輸精管動脈外傷、睪丸扭轉等都可導致精子生成障礙，引起無精癥的發生。
睪丸本身病變
睪丸外傷、炎癥、扭轉、睪丸血管病變、流行性腮腺炎合并睪丸炎等所致的睪丸萎縮均可破壞精子生成環境，致精子生成障礙，引發無精癥。
內分泌疾病
垂體功能亢進或低下、垂體腫瘤、腎上腺功能亢進或低下、甲亢或甲減均可影響精子生成而造成無精子癥。
嚴重全身性疾病及營養不良
嚴重全身性疾病和營養不良都可導致睪丸發育異常，引起男性無精癥。