1.手術切除
可行全切或次全切，但腫瘤與頸內動脈、視神經等周圍組織緊密相連且大的瘤體對周圍組織的侵潤，其效果往往不能令人滿意，復發率高，且易產生下丘腦損傷引起尿崩癥，體溫失調，無菌性腦膜炎。手術后癥狀改善亦不理想。
2. 頭部伽瑪刀治療
伽瑪刀治療顱咽管瘤目前技術很成熟，因為伽瑪刀治療的精確性，所以很少能傷害到腫瘤周邊的正常組織。對于有囊性變的腫瘤，可以在伽瑪刀治療后對囊液進行穿刺。
3.中醫治療
抗瘤正腦系列的配伍應用，適用于未行手術或手術部分切除，術后復發，X-刀、γ-刀，放化療后患者用藥3個月左右可消除癥狀，使瘤體縮小或消失，手術用藥可消除殘瘤，預防復發，臨床應用多年來療效確切。