自閉癥不是由父母的養育態度所造成，他的成因目前醫學上并無定論，很可能是多方面的因素造成腦部不同地方的傷害。至于可能造成自閉癥的因素，則有下列幾項：
(一)遺傳的因素：20%的自閉癥者中，他的家族可找到有智能不足、語言發展遲滯和類似自閉癥的。此外，自閉癥男童中約10%有染色體脆弱癥。
(二)懷孕期間的病毒感染：婦女懷孕期間可能因麻疹或流行性感冒病毒感染，使胎兒的腦部發育受損傷而導致自閉癥。
(三)新陳代謝疾病：如苯酮尿癥等先天的新陳代謝障礙，造成腦細胞的功能失調和障礙，會影響腦神經訊息傳遞的功能，而造成自閉癥。
(四)腦傷：自閉癥的原因包括在懷孕期間窘迫性流產等因素而造成大腦發育不全，生產過程中早產、難產、新生兒腦傷，以及嬰兒其因感染腦炎、腦膜炎等疾病造成腦部傷害等因素，都可能增加自閉癥機會。
(五)當然還有其他關于原因方面的探討，但無一確切原因。了解自閉癥的病因對患者全面的治療很有幫助，但是治療自閉癥一定要選擇正確的治療方法。