卵巢癌經常與其他疾病相混淆，卵巢癌的鑒別成了一個難題。腹部膨脹感或包塊、月經紊亂、陰道出血，腹痛和腰痛是卵巢癌常見的臨床癥狀和體征，與慢性尿潴留、盆腔炎性包塊、盆腔子宮內膜異位癥、附件結核或腹膜結核、卵巢良性腫瘤和肝硬化腹水的一些癥狀相似，要注意鑒別。
1、 慢性尿潴留
多有排尿困難或尿頻尿不盡等癥狀，包塊在下腹正中的位置，邊界不清楚導尿后包塊很快消失，用B超很容易鑒別。
2、 盆腔炎性包塊
炎癥可形成實質性、不整齊的固定包塊，或宮旁結締組織炎呈炎性浸潤達盆壁與卵巢癌癥狀相似。盆腔炎性包塊病人往往有人工流產術、上環、取環和產后感染等病史。盆腔炎主要表現為發熱，下腹痛，病程長等臨床表現，雙合診檢查觸痛明顯，應用抗炎治療包塊縮小。在必要時要進行包塊細胞學檢查。
3、盆腔子宮內膜異位癥
此病所形成的粘連性卵巢包塊及子宮直腸陷凹結節與卵巢癌的癥狀十分相似，但此病常為生育期年齡病人，有進行性痛經，隨月經周期加重及不孕等特征進行鑒別。必要時行腹腔或剖腹探查確診。
4、 附件結核或腹膜結核
常有結核病史，其臨床表現也有不同，附件結核有消瘦、盜汗、低熱、面色潮紅、閉經等癥狀。腹膜結核腹水時出現粘連性腫塊，特點是位置高，B型超聲、X線胃腸造影等可幫助確診，利于鑒別。
5、 卵巢良性腫瘤
良性腫瘤病程相對來說比較長，腫塊逐漸增大，常發生于單側，活動度較好，質地軟，表面平整光滑，包膜完整無缺損，這種腫瘤比較常見，病人一般狀況較好。相反，卵巢癌惡性腫瘤病程短，腫塊生長比較快，活動度差，質地堅硬，表面不光滑有裂痕，經三合診檢查，可觸知腫瘤有乳頭狀結節，并常常伴有全身或下肢浮腫、惡病質、血性腹等表現。必要的情況下可作腹腔鏡及剖腹探查，以進一步明確診斷。