診斷甲狀腺結節時，病史、體格檢查和影像學檢查是十分重要的環節，重點在區別結節良惡性質。觸診和超聲診斷是甲狀腺結節診斷的兩種重要方式。
(1)甲狀腺結節>TSH，FT4>甲狀腺功能正常>細針穿刺>惡性或可疑>冰凍切片>惡性>幾近甲狀腺全切。
(2)如果出現良性或不能決定>部分甲狀腺切除或6個月后重復穿刺>仍標本量不足>臨床可疑>部分甲狀腺切除或觀察。
(3) 細真穿刺后如標本量不足>實性結節或囊性結節>重復穿刺標本量仍不足或反復發作或縮小>臨床可疑>觀察或部分甲狀腺切除。
(4) 甲狀腺結節或甲亢>甲狀腺掃描>冷結節>治療。
(5) 甲狀腺結節或甲亢>甲狀腺掃描>熱結節>細針穿刺>出現惡性>幾近甲狀腺全切;若出現可疑、良性或標本不足>可行冰凍切片>良性或不以決定>部分甲狀腺切除。
(6)如果是良性6個月重復穿刺>仍標本量不足>臨床可疑>部分切除或觀察;再標本量不足的情況下如果出現實質性結節或囊性結節>重復穿刺仍標本量不足或反復發作或縮小>臨床可疑>部分切除或觀察。
觸診的另一個缺點是難以判斷甲狀腺結節的性質，難以區分這個結節是良性的還是惡性的，是炎性的還是非炎性的。