脊柱結核的治療目的是消除感染，防止脊柱畸形和神經功能障礙。隨著特異性抗結核藥物的應用，脊柱結核的發病率和死亡率都明顯下降。對于無嚴重并發癥的患者，基本上可通過藥物治療和手術治愈。
脊椎結核無手術指征的病人，應用合理的化療方案治療和局部制動基本可治愈。抗結核藥物化學治療對于結核病的控制起著決定性作用。合理的化療可使病灶全部滅菌、痊愈。對活動性結核病堅持“早期、聯用、適量、規律和全程使用敏感藥物”的原則。我國目前的骨、關節結核標準化療方案是：異煙肼、利福平、乙胺丁醇、鏈霉素(INH+RFP+EMB+SM )聯合應用。強化治療3 個月后停用鏈霉素，繼續用異煙肼、利福平、乙胺丁醇6～15個月(即3 SHRE/6～15 HRE)，總療程9～18個月。無論制定何種化療方案務必堅持個體化。
脊柱結核的手術適應證是：(1)脊髓受壓引起神經體征;(2)明顯畸形或椎體嚴重破壞;(3 )保守治療效果不佳的混合性感染;(4)持續疼痛或血沉持續在高位;(5)竇道形成且合并感染者。根據其歷史發展過程，其手術方式有：病灶清除術，香港術式(前路病灶清除、自體骨植骨融合術)，病灶清除、植骨融合、內固定術。
20世紀90年代出現的電視輔助胸腔鏡手術(VATS)具有創傷小、痛苦輕、恢復快、療效可靠、符合美容要求等優點。很多學者將其應用到多種胸椎疾病的診治中，在胸椎結核的診治中，取得了滿意療效。結合擴大操作通道技術，將胸腔鏡和常規脊柱器械聯合使用，為脊柱結核手術治療提供了新的可供選擇的方法。對脊柱結核病變部位進行穿刺，經皮置管即可置管、灌洗及化療等。對有某些神經壓迫癥狀者，可以利用微創手術器械行簡單的病灶清除術。