尖銳濕疣的典型病例，肉眼可作出診斷。外陰有尖銳濕疣者，應仔細檢查陰道及宮頸以免漏診。對體征不典型者，則需進行輔助檢查以確診。主要輔助檢查有以下幾種。
1.細胞學檢查
可見到挖空細胞，表現為中層細胞核大，有時可見到雙核，核深染，核周有大空泡，雖然挖空細胞的特異性較高，但挖空細胞的檢出率較低。
2.陰道鏡檢查
陰道鏡檢查對發現宮頸病變頗有幫助。典型病灶表現為每個乳頭狀突起的半透明表皮下都有中央血管袢。宮頸涂以3%醋酸后，可見移行區內外鱗狀上皮呈白色斑塊，襄面隆起不平或為小乳頭指樣突起，有中央毛細血管，也可表現為點狀血管呈花壇狀或呈細小鑲嵌排列。
3.病理組織學檢查
尖銳濕疣鏡下呈外向性生長，增生的乳頭小而密集，表層細胞有角化不全或過度角化;棘細胞層高度增生，有挖空細胞出現，為HPV感染的特征性改變;基底細胞增生，真皮水腫，毛細血管擴張，周圍有慢性炎細胞浸潤。
4.聚合酶鏈反應-PCR)
PCR方法簡便、快速、敏感性高，特異性強。可檢測極微量HPV DNA，不僅可確診是否為HPV感染，且能確定HPV類型。注意取新鮮病變表面的刮取物或病變組織以提高陽性率。
5.核酸DNA探針雜交
以原位雜交應用較多。原位雜交是直接在組織切片或細胞涂片上進行雜交反應，通過光鏡檢查。此法有助于對組織學可疑病變的鑒別。