灰指甲患者甲板常呈混濁、肥厚、表面凹凸不平，或甲板萎縮、變薄、前緣破壞、甚至脫落。甲可呈白色、黃色、灰色、黑色等顏色，念珠菌所致者常伴有甲溝炎。其臨床表現根據侵犯部位及程度的不同可分為四型：
遠端側位甲下型
此型最為常見，甲前緣和側緣甲下混濁肥厚，表現凹凸不平。由于炎癥刺激，使加下角質增生，甲板與甲床分離，甲板游離緣翹起，甲板脆弱易折斷。甲前緣呈蟲蝕狀缺損，隨著病情發展，甲板可全部損毀。此型多由皮膚癬菌引起。
白色淺表型
本型常見于趾甲。在甲板淺層形成霧狀白色混濁，又稱真菌性白甲，日久顏色變黃，甲板脆弱易破損。此型多見為須癬毛癬菌感染，其次為小孢子菌等引起。
近端甲下型
本型較少見病變始于甲表皮護膜，并沿近端甲根部下面和甲上皮發展，甲板粗糙凹凸不平，常伴有甲溝炎。此型病原菌主要為紅色毛癬菌，其次為紫色毛癬菌，絮狀表皮癬菌等，念珠菌感染亦可見到。
全甲營養不良型
以上各型均可發展成此型，可見整個甲板破壞，甲板脫落，甲床表面殘留粗糙角化物。