目前尚無根除尖銳濕疣(HPV)的方法，治療原則為去除外生疣體，改善癥狀和體征。常需要藥物、手術、物理、免疫綜合治療。
1.局部藥物治療
用藥前，局部涂以1%的丁卡因行表面麻醉以減輕疼痛。①33%~50%叁氯醋酸外涂，每周1次，一般1-3次后病灶可消退。叁氯醋酸毒性小，對周圍正常皮膚無損害，病變修復后不形成瘢痕，可用于陰道及宮頸病變。②1%酞丁安膏涂擦，每日3-5次，4-6周可望痊愈，刺激性小，被廣泛應用。③10%-25%足葉草脂涂于病灶，本藥具有細胞毒性，能抑制細胞分裂的M期，刺激性大，注意不要涂及正常皮膚，不能用于陰道及宮頸病變，涂藥后2-4小時洗去，每周1次，可連用3-4次。④5%氟尿嘧啶軟膏外用，每日1次，10~14日為1療程，一般應用1-2個療程。
2.物理或手術治療
物理治療有微波、激光、冷凍。微波是在疣體基底部凝固，因其為接觸性治療，可適用于任何部位尖銳濕疣。激光適用于任何部位疣及難治療、體積大、多發疣。冷凍適用于疣體較小及病灶較局限者。巨型尖銳濕疣可用微波刀或手術切除。
3.干擾素治療
干擾素具有抗病毒、抗增殖及調節免疫作用。可表現為限制HPV病毒的復制;減慢病變部位中細胞的分裂速度;增強宿主對感染HPV的防御反應。常用基因工程重組干擾素(YIFN)a-2a，劑量100萬u，隔日肌注1次，連續3-4周為一療程，也可采用病灶基底部局部注射。干擾素一般不單獨使用，多作為輔助用藥。 對反復發作的頑固性尖銳濕疣應及時取活檢排除惡變。