月經不調是黃體功能不全的典型癥狀。一般來說，女性黃體期是指月經周期第15～29天，排卵后的卵泡形成黃體，分泌大量的孕酮和雌激素，孕酮于第22～23天升至峰值，此時測定孕酮水平、評估黃體功能最可靠，子宮內膜繼續增厚，到月經來之前為15～19mm。黃體功能不全導致月經不調的表現如下：
經期延長
表現為月經周期正常，經期延長，經期超過7天以上，甚至2周方凈。有炎癥者平時小腹疼痛，經期加重，平時白帶量多，色黃或黃白、質稠、有味。黃體萎縮不全者同時伴有月經量多;子宮內膜修復延長者在正常月經期后，仍有少量持續性陰道出血的癥狀發生。
經期提前
有典型癥狀，月經周期短于21天，有規律。基礎體溫雙相，卵泡期短，僅7-8天;或黃體期短于10天，或體溫上升不足0.5℃。子宮內膜活檢分泌反應差，或仍停留在早期分泌階段。
經期延遲
月經延遲7天以上，甚至40～50天一次月經，并連續出現2個月經周期以上的癥狀。有排卵者，基礎體溫雙相，但卵泡期長，高溫相偏低;無排卵者，基礎體溫單相。