肛周濕疹與肛門瘙癢癥的鑒別：濕疹常發有丘疹、紅斑、滲出、糜爛，以后繼發瘙癢，而后者常以發癢為主，無滲出液，搔抓破后，繼發滲出、出血、糜爛。
肛周濕疹與接觸性皮炎的鑒別：后者有明顯的接觸物刺激病史，容易查清，皮疹僅限于接觸部位，形態單一，水皰大，境界清楚，去除病因后，皮炎消退較快，很少復發。
肛周濕疹與肛周神經性皮炎的鑒別：后者常發瘙癢，后出現扁平丘疹，有苔癬樣變，淡褐色，干燥而堅實，病變部位可延至骶尾部、會陰及陰囊。
怎樣辨別肛竇炎和肛周濕疹?
肛竇炎：急性發炎時，肛門灼熱、疼痛，有下墜感，大便時疼痛加重，嚴重者即使不大便，也常有短時間陣發性刺痛，疼痛可向臀部和股部后側放射。慢性緩解期，幾乎無明顯癥狀，僅在排便后肛內有短暫的微痛。常有大便帶有少量粘液或粘液常在糞便前流出，有時呈血性。本病發病原因是當大便干燥或腹瀉時，糞便磨損肛門瓣，受細菌感染引發肛竇炎。
肛周濕疹：是一種過敏性、炎癥性肛周皮膚病，它具有多形性損害，反復發作，易演變成慢性等特點。癥狀主要是肛門及周圍陣發性劇烈瘙癢;此外，還有肛門濕潤不適，疼痛，以及其他全身癥狀，如消化不良、腹脹、便秘、腹瀉等。發病因素為慢性消化系統疾病，精神緊張，內分泌功能失調，以及外用藥及化學物品的刺激等。治療時應根治原發病，改善和除去誘發因素，保持內褲清潔避免搔抓。