性交障礙的病因一般有社會文化背景因素、不正確的知識、個人因素、雙方關系、其他疾病影響身體導致性欲降低等。如果夫妻間感情出現障礙，特別是若已達到破裂的程度，對對方產生厭煩心理，性欲大多減退，就會出現性交障礙。
社會文化背景因素(20%)
科學的性知識過去研究得很少，傳布更不廣，因此人們關于性的知識往往是道聽途說而來，一般都認為談論性問題是“下流”的，因此即使夫妻之間，也不一定有充分的交流，不知道什么樣是適當的性行為，有了問題也不敢尋求幫助。
不正確的知識(10%)
例如認為性行為應隨停經而終止，到了一定年齡就不會有性能力，患某些疾病影響性行為等，過去認為手淫可引起性生理功能障礙，其實這是一種誤解，手淫一般只引起睡眠不足，影響次日的精力，不引起特定的疾病。
個人因素(15%)
最常見的是焦慮，例如怕自己的性能力不足以滿足對方要求，怕懷孕，怕性行為被人發覺，怕被缺乏感情認為淫蕩等。
雙方關系(10%)
例如對對方過分尊重，恐懼，厭惡，雙方缺乏感情或缺乏交流等。
其他疾病(20%)
某些疾病或某些藥物確實可以影響性能力，特別是影響男性的勃起，一般言，急性病或短期用藥雖常可影響性功能，但不引起注意;慢性病因為時間長，所以引起注意，其他疾病引起的性功能障礙只占少數，有一些還是因為焦慮引起的，例如怕進行性交加重疾病。