根據甲亢病因的不同，種類也不同，所以在治療上也是不一樣的，要結合具體的發病原因和特征進行治療，通常狀況下治療方法包括以下幾種。
藥物治療
這是一種較為普遍的治療方法，是通過口服抗甲狀腺藥物來達到治療的效果，適合病情較輕、甲狀腺腫大不嚴重，及老人、兒童等不宜手術的人。在治療過程中不能擅自停藥，這樣會增加甲亢的復發幾率。大多數人均能耐受，少部分會產生過敏、肝腎功能損害現象，肝腎功能不全患者不能采用此療法。
手術治療
此方法是采用將腫大部分的甲狀腺切除的原理治療，適宜中、青年人群。手術要求醫生技術性高，如果手術做不好可出現嚴重低鈣、磷現象造成終身手足抽蓄，還可能會有其他并發癥的產生，但是其治愈率較高。
放射性碘治療
這種方法是將碘標記上放射性物質后制成放射性碘，然后進行治療。此方法安全便利，但是也會對甲亢病人造成影響，即甲減的發生。因對生殖器官的影響較大，年輕少女或未婚女性不宜采用此種方法治療。另外，母體在攝入放射性碘后，可以通過胎盤或乳汁進入胎兒或嬰兒的甲狀腺，造成胎兒或嬰兒呆小癥，孕婦及哺乳期婦女也不宜采用。
中醫治療
中醫治療是通過調節臟腑的功能來促進自身免疫系統的修復，從根本上出發以達到徹底治愈的效果，安全性高，但治療過程慢長。