肝移植術后的患者，約60%可經證實有過巨細胞病毒感染，但有臨床癥狀的僅為一半。感染分為兩種類型：一種為巨細胞病毒陰性受者接受了陽性的供肝或供血，而出現原發性感染;另一種為潛在巨細胞病毒陽性受者的再次發作。
診斷依靠陽性巨細胞病毒培養結果及血清學改變。兩種形式感染的發生頻率相等，嚴重程度近似。巨細胞病毒感染可以為輕型發作，表現為短期輕度發熱，且不需要治療，或為嚴重型發作，伴高熱并侵及肺、肝、腎、胃腸道等，有時會出現視網膜炎。
巨細胞病毒肝炎在組織學具有特異性表現，通過肝活檢鑒別包涵體及做特異性抗巨細胞病毒血清免疫組織化學法檢查，很容易做出診斷。胃腸道彌散性受累，內窺鏡檢查容易誤認為胃炎或結腸炎。因巨細胞病毒致死的，多為間質性肺炎的患者。