卵巢早衰的確切病因不明，一般認為，其發病原因可由先天性濾泡過少或性染色體異常所致，如決定性腺分化的X染色體上基因異常而影響性腺發育。60年代后發現部分卵巢早衰病人中合并有自身免疫病,如愛迪森氏病、Hashimoto甲狀腺炎或類風濕病等，其卵巢切片中顯示淋巴細胞浸潤，周圍血或卵巢組織內找到抗卵巢組織、抗內卵泡膜細胞，抗顆粒細胞、抗卵泡刺激素受體等抗體，因而提出本病30%--50%為自身免疫病——自身卵巢組織的免疫性卵巢炎。
卵巢早衰的確切病因不明，一般認為，其發病原因可由先天性濾泡過少或性染色體異常所致，如決定性腺分化的X染色體上基因異常而影響性腺發育。60年代后發現部分卵巢早衰病人中合并有自身免疫病,如愛迪森氏病、Hashimoto甲狀腺炎或類風濕病等，其卵巢切片中顯示淋巴細胞浸潤，周圍血或卵巢組織內找到抗卵巢組織、抗內卵泡膜細胞，抗顆粒細胞、抗卵泡刺激素受體等抗體，因而提出本病30%--50%為自身免疫病——自身卵巢組織的免疫性卵巢炎。