預防小兒弱智主要是消除病因，要開展遺傳咨詢，避免近親結婚，加強孕期保健。妊娠期間注意營養，避免接觸有害化學物質，戒煙、戒酒，絕對禁止攝入毒品，避免服用可能致畸藥品，避免接觸放射線;預防病毒及原蟲感染;做好產前檢查，預防妊娠并發癥，完善產科技術，避免病理分娩。做好兒童保健工作，實行計劃免疫，預防傳染病，尤其是神經系統感染，注意營養和衛生，防止中毒，避免腦外傷。宣傳育兒知識，提高父母文化水平。
小兒弱智一經產生，很難治好，因此預防十分重要，預防措施包括：提高年青夫婦的健康水平，避免近親結婚，有遺傳病者避免生育，懷孕后有問題者要進行檢查診斷，必要時可終止妊娠，及時發現和防治嬰幼兒的疾病，特別是神經系統疾病。
學齡前期(6歲左右以前)，積極預防以下病的發生：感染，顱腦外傷，因各種原因引起的腦缺氧，中毒，內分泌或代謝疾病，疫苗接種后腦炎，癲癇，嬰幼兒期嚴重營養不良或其他疾病，因為盲，聾而影響智力發育，以及嚴重缺乏受教育的機會等。
(1)進行遺傳代謝檢查及咨詢，避免近親婚姻、發現攜帶者應進行遺傳咨詢，做到優生優育。
(2)適齡生育，要做好產前和圍產期的保健工作，羊水檢查，包括染色體病、神經管畸形、代謝疾病等疾病的檢查，高危妊娠管理、新生兒重癥監護、勸阻孕婦飲酒吸煙、避免或停用對胎兒發育有不利影響的藥物等措施。科學方法接生。
(3)普及衛生教育和營養指導。
(4)做好傳染病、病毒、細菌、原蟲的免疫接種。
(5)預防各種感染及意外事故的發生，減少顱腦外傷及意外事故，正確治療腦部疾病、控制癲癇發作。
(6)加強學前教育和早期訓練，對學齡前兒童定期進行健康檢查(體格、營養、精神心理發育、視覺和聽覺)。禁止對小兒忽視和虐待。
(7)對高危新生兒進行隨訪，早期發現疾病，給予治療，尤其應該注意，早期營養(蛋白質和鐵、鋅等微量元素)供應和適當的環境刺激對智力發育有良好作用;注意做新生兒代謝疾病(如甲狀腺功能低下、苯丙酮尿癥)篩查。