一、發病原因
對兒童抽動癥的病因尚未完全弄清。認為有特殊素質的兒童，當有各種精神因素或模仿他人動作時，易形成異常運動性條件反射。
二、發病機制
兒童在發育過程中，大腦運動分析器興奮性高，容易發生抽動性反應，尤其在具有特殊素質的兒童，當有各種精神因素或模仿他人動作時，均易形成這類運動性條件反射，成為病理性惰性反應。開始可能是患者對某些刺激的反應，日久則成為習慣性抽動。
1.遺傳因素
短暫性抽動障礙可有家族聚集性，患兒家族成員中患抽動障礙較多見，故認為可能與遺傳因素有關。
2.軀體因素
開始時往往由于局部刺激而產生抽動。如眼結合膜炎、倒睫刺激引起眨眼，鼻炎或上呼吸道感染而出現吸鼻、面肌抽動。當局部疾病因素去除后，抽動癥狀仍繼續存在。
3.體質因素
有抽動癥的小兒，一般不安靜，對人對事較敏感，神經質，要求水準高，有固執傾向。并常合并一些心理性癥狀，如頭痛、腹痛、不明原因的發熱、便秘、哮喘、遺尿等。
4.情緒因素
常與家庭有關，常見的因素如父母對患兒過高的學習要求，過多的責備，母親常有神經質，精神上不安靜。過多的干預使小兒發生情緒障礙，特別是焦慮和緊張等情緒，抽動即是心理上的矛盾沖突在運動系統方面的反應。家庭的爭執，父母離婚，親人死亡等。另外，還有人認為與患兒曾有過運動活動遭受限制的歷史有關，如父母對兒童安全過分擔心或早年的某些疾病限制了兒童的活動。精神上的刺激也可成為誘因。或患兒近期遭受意外事件如生病住院、遇見危險等。或患兒看緊張的電視、錄像節目，玩緊張的游戲如打游戲機等，抽動成為心理應激的一種表現。這一因素在短暫性抽動障礙中起主要作用。
5.學習理論
開始時的抽動可能是出于條件性的逃避反應，如眼中有異物而眨眼，或學習其他人的某些生理缺陷或病態，后來由于外界的原因起到了增強作用，以致形成了習慣性抽動。
6.藥源性因素
中樞神經興奮劑如哌甲酯、抗精神病藥的長期服用可能產生抽動癥的不良反應。