飲食不足(20%)
嬰兒進食太少時，消化后液體吸收，余渣少，致大便減少，變稠，奶中糖量不足時腸蠕動弱，可使大便干燥，飲食不足時間較久引起營養不良，腹肌和腸肌張力減低甚至萎縮，收縮力減弱形成惡性循環，加重便秘。
食物成分不當(15%)
如食物中含大量蛋白質而碳水化合物不足，腸道菌群對腸內容物發酵作用減少，大便易呈堿性，干燥。如食物中含較多的碳水化合物，腸道發酵菌增多，發酵作用增強，產酸多，大便易呈酸性，次數多而軟;如食入脂肪和碳水化合物都高，則大便潤利。
腸道功能失常(20%)
生活不規律和不按時大便，未形成排便的條件反射導致便秘很常見，常用瀉劑或灌腸，缺少體力活動，或患慢性病如營養不良，佝僂病，高鈣血癥，皮肌炎，呆小病及先天性肌無力等，都因腸壁肌肉乏力，功能失常而便秘，交感神經功能失常，腹肌軟弱或麻痹也常使大便秘結，服用某些藥物可使腸蠕動減少而便秘，如抗膽堿能藥物，抗酸藥，某些抗驚厥藥，利尿劑以及鐵劑等。
體格與生理的異常(20%)
如肛門裂，肛門狹窄，先天性巨結腸，脊柱裂或腫瘤壓迫馬尾等都能引起便秘，應進行肛門，下部脊柱和會陰部檢查，有的患兒生后即便秘，如有家族史可能和遺傳有關。