在體檢的時候，如果發現血清甲胎蛋白的升高，或者肝臟內發現了占位性病變，則應懷疑是否得了肝癌，患者此時應該做的是，明確診斷，確定是否真的是患了肝癌，如果甲胎蛋白明顯升高，超聲檢查或CT檢查符合肝癌的特征表現，則可以診斷為肝癌。
如果甲胎蛋白不升高，這時就需要兩種以上的影像學(如超聲、CT或者核磁共振)檢查都符合肝癌的特征表現，才能做出肝癌的診斷。
有時候會發現甲胎蛋白升高，但超聲、CT或者核磁共振都沒有發現肝臟內占位性病變，這種情況下就需要鑒別甲胎蛋白升高的原因是什么了，通常情況下，首先要排除生理情況下的甲胎蛋白升高的原因，例如孕婦的甲胎蛋白會升高;其次，肝炎活動也會導致甲胎蛋白的升高;再次，其他癌癥也可引起甲胎蛋白的升高，如胃癌、賁門癌、胰腺癌等;最后，微小肝癌也可引起甲胎蛋白的升高。
如果明確是肝癌后，就需要確定腫瘤的大小、數目、位置、以及肝臟功能的代償情況，然后考慮制定治療方案。