IBS起病隱匿，癥狀反復并遷延，但患者全身情況基本不受影響。其癥狀無特異性，所有癥狀皆可見于器質性胃腸病。典型癥狀為與排便異常(形狀/次數)相關 的腹痛、腹脹。根據主要癥狀分為：腹瀉主導型;便秘主導型;腹瀉便秘交替型。精神、飲食、寒冷等因素可誘使癥狀復發或加重。
1.腸易激綜合征的癥狀
(1)腹痛
是IBS的主要癥狀，伴有大便次數或形狀的異常，腹痛多于排便后緩解，部分病人易在進食后出現。腹痛可發生于腹部任何部位，局限性或彌漫性。疼痛性質多樣、程度各異，但不會進行性加重。極少于睡眠中發作。
(2)腹瀉
① 持續性或間歇性腹瀉
糞量少，呈糊狀，含大量黏液，但無血液，鏡檢大致正常;②禁食72h后癥狀消失;③夜間不出現，有別于器質性疾患;④約1/4患者可因進食誘發;⑤不少患者有腹瀉與便秘交替現象。
(3)便秘
排便困難，大便干結、量少，可帶較多黏液。便秘可間斷或與腹瀉相交替，常伴排便不盡感。早期多為間斷性，后期持續存在，甚至長期依賴瀉藥。
(4)腹脹
白天較重，尤其在午后。夜間睡眠后減輕。腹圍一般并不增大。
(5)非結腸源性癥狀和胃腸外癥狀
近半數患者有胃灼熱、早飽、惡心、嘔吐等上胃腸道癥狀。疲乏、背痛、頭痛、心悸、呼吸不暢、尿頻、尿急、性功能障礙等胃腸外表現較器質性腸病顯著多見。部分病人尚有不同程度的心理精神異常表現，如焦慮、抑郁、緊張、多疑、敵意等。
2.腸易激綜合征的體征
盲腸和乙狀結腸常可觸及，盲腸多呈充氣腸管樣感覺;乙狀結腸常呈索條樣痙攣腸管或觸及糞塊，所觸腸管可有輕度壓痛，但壓痛不固定，持續壓迫時疼痛消失，部分病人肛門指診有痛感，且有括約肌張力增高的感覺。
3.腸易激綜合征的并發癥
癥狀出現或加重常與精神因素或一些應激狀態有關，部分病人伴有上胃腸道及腸道外多種功能紊亂的癥狀，還可伴有心理精神異常表現，如抑郁，多疑，緊張，焦慮，敵意等。