醫生在體檢時除發現尿道口有少量清稀的粘液性分泌物外，無其他異常體征可見。顯微鏡油鏡下檢查經革蘭氏染色的尿道分泌物涂片，發現大量白細胞，僅偶見革蘭氏陰性或陽性細菌。這一結果顯示存在感染，但仍無法從顯微鏡檢查得出肯定結論。若在細胞內或細胞外找到革蘭氏陰性雙球菌則可診斷為淋病的存在。而非淋菌性尿道炎通常是由兩種比細菌小而又略大于病毒的微生物─沙眼衣原體和解脲支原體感染的。

　　近幾年來，衣原體和支原體感染成了不育癥診斷與治療中的一個熱門話題

　　在不育門診的精液檢查中或在前列腺門診的前列腺液檢查中，當把顯微鏡調到1000倍視野時，往往可以在部分患者的樣本中見到密密麻麻的小顆粒在快速抖動，它們不是直線前進，而是繞來繞去打轉轉。它們的大多數是黑黑的渾園形顆粒，也有的是橢園形或桿狀的顆粒，它們就是我們將要介紹的衣原體或支原體。

　　它們是比細菌還要小而比病毒又略大的原核細胞型病原微生物，直徑只有0.3微米左右，大約為精子頭大小的1/20。有的顆粒看上去很大，其實是好幾個小顆粒粘附在一起的，有時它們還會十幾個或幾十個成串或成群活動。

　　衣原體有細胞壁而呈球形，支原體無細胞壁而形狀不定，它們都喜歡附著在其他固體成分上，這是它們的重要特征之一，如果仔細觀察就不難發現它們簡直是無孔不入的。除附著在精子頭、頸和尾部外，它們還附著在白細胞上、脫落到精液里的不成熟生精細胞上、還有前列腺小體上。

　　醫生有時還可以看到精子頭或尾、甚至整個精子都包裹上一層厚厚的粘稠物質，它們是神經氨酸醛等物質，雖多次洗滌都洗不掉。不論是附著了許多衣原體顆粒還是包裹了一層盔甲，精子都不堪重負，無法像健康時飛快地游動，當然也就很難到達輸卵管與卵子會合和受精了，這是其造成不育的原因之一。

　　感染了衣原體或支原體患者的畸形精子率將大大增高，往往達60-75%，如頭尾腫大，尾部繞圈。由于衣原體等附著于精子表面，在掃描電子顯微鏡下可以看到這些顆粒像粘上去的一顆顆花椒，若在尾部則像一串串的糖葫蘆。衣原體附著后可使精子細胞膜損傷，并通過它釋放的毒性物質使精子受到急性毒性作用，進而導致精子的代謝、生物合成、生理和免疫功能發生損傷。由于衣原體等的附著遮蓋了精子識別卵子的部位，也會影響精卵結合，最終導致不育。

　　此外，醫生們還注意到支原體與人類精子膜具有共同抗原成分，所以病人在感染后產生的抗支原體抗體也會作用于精子，進而引起不育。凡此種種。都有可能影響到男子的生育力。