目前對肝血管瘤的治療方法存在較大爭議，主要有血管瘤切除術、血管瘤縫扎術、肝動脈結扎術、微波固化術、射頻治療、肝動脈栓塞術等。對于彌漫性的肝血管瘤，或者無法切除的巨大血管瘤，如肝功能失代償或合并Kasabach-Merritt綜合征，也可行肝移植治療。對于需要治療的肝血管瘤，應綜合多種因素考慮，以病人獲益、安全、有效為原則，依據醫生的技術水平和經驗，多種因素間權衡，選擇不同的治療方式。
1.肝血管瘤切除術
手術切除效果可靠、安全，完整切除是惟一能夠根治的方法。隨著外科技術的發展，目前手術相關并發癥發生率及病死率已很低。盡管如此，手術仍需嚴格掌握適應證。常見的手術方式包括肝段切除術、血管瘤剝除術、腹腔鏡肝切除術、血管瘤縫扎術、肝移植等。
2.非手術治療
(1)肝動脈栓塞術(TAE)
TAE治療肝血管瘤是借鑒于TAE治療肝癌的經驗，理論是基于肝血管瘤主要由肝動脈供血，栓塞動脈后瘤體內可形成血栓，血栓機化、纖維化使瘤體形成纖維瘤樣結構而達到縮小、硬化血管瘤的目的。但對TAE治療肝血管瘤仍有爭議，其原因是大血管瘤的長期效果差，難以使瘤體縮小機化。且栓塞劑術中在對血管瘤起栓塞作用的同時，也常常累及到肝門部及肝內膽管的正常血液供應，可造成一些嚴重的并發癥，如膽汁瘤、肝細胞壞死、肝膿腫、膽汁性肝硬化、膽道缺血性狹窄及膽管動脈瘺等。同時，血管硬化劑平陽霉素副作用雖少，但引起肺纖維化和大劑量動脈內使用時損傷動脈內膜的副作用也不可低估。
(2)肝血管瘤微波固化術及射頻治療
肝血管瘤微波固化術及射頻治療微波可轉化為熱能而使周圍組織凝結，使瘤體局部萎縮、變硬，達到固化腫瘤的目的。采用此法必須阻斷第一肝門，以減少瘤體內血液流動。較大的肝血管瘤，微波治療難以將瘤體完全固化，術后復發率較高。射頻原理與微波相似，對小血管瘤治療效果尚可，對>8cm治療效果不佳，甚至會引發大出血。特別是瘤壁組織菲薄，纖維組織少的瘤體穿刺時易發生不可控制的出血，是微波固化或射頻治療的禁忌。