男性性功能障礙有以下幾種分類方法：
1. 按病因分類：器質性和精神性。
2. 按發生時間分為：原發性和繼發性。原發性即第一次性接觸即已存在障礙，繼發性為性功能障礙發生前至少已有過一次以上的性高潮。
3. 按性過程分為：性欲障礙、勃起障礙、射精障礙和性感覺障礙。
(1)性欲障礙：主要有性欲低下、性厭惡、性欲亢進及性欲倒錯，其可以是器質性病變和心理因素異常所致。
(2)勃起障礙：最為常見，有兩種：①陽痿：現統稱為勃起功能障礙(erectile dysfunction，ED)，指男性陰莖不能勃起和(或)不能維持勃起以達到滿意的性生活。可分為心理性、器質性及混合型。②陰莖異常勃起：是指陰莖持續勃起，以至疼痛。常為器質性病變所致。
(3)射精障礙：射精過程時間上發生的障礙，包括早泄、延遲射精;射精過程本身發生障礙，如不射精、逆行射精;其他的有頻繁遺精、滑精或精溢等。
(4)性感覺障礙：常見的有性交疼痛、痛性勃起、痛性射精、外生殖器感覺異常和性欲高潮感覺減退。
男子性功能是生殖過程中一個重要的環節，性功能障礙會導致男性不育，同時也會影響夫妻感情，必須引起足夠重視。