一、一般治療
除非患者一般情況很差，無需臥床休息，可參加適量的勞動和工作。生活要有規律，經常參加適當的文娛活動，對平日體育活動較少的患者應強調體育鍛煉，以增強體質，加速神經功能的恢復。飲食以少渣、易消化食物為主，避免刺激性飲食和濃烈的調味品。神經性厭食患者須住院治療，并逐漸培養正常飲食習慣。凡嚴重營養不良、消化與吸收功能減退、鼻胃管進食又引起腹瀉的患者，需要靜脈輸入營養液。以便秘為主的腸激惹綜合征患者多食纖維蔬菜往往有治療效果。
二、藥物治療
(一)調節神經功能，改善睡眠
根據病情，可選用下述藥物與方法。
鎮靜劑可給予利眠寧、安定、氯丙嗪、苯巴比妥、眠爾通或谷維素等。
伴有精神抑郁的患者可酌有抗抑郁藥，如阿米妥林(amitriptyline)開始25mg每日三次，每日最大劑量為150mg.
(二)解痙止痛
抗膽堿能藥物可使平滑肌松弛，有解痙止痛作用;如顛茄制劑、阿托品、普魯本辛等。此外，可試用鹽酸雙環胺(Dicyclomine hydrochloride)20毫克，餐前1小時和睡前服。
(三)神經性嘔吐
可用維生素B610-20毫克，每日三次或100毫克加入50%葡萄糖40毫升靜脈注射。嘔吐劇烈酌情給予冬眠靈、異丙嗪、嗎丁啉等。病情較重者可采取用鼻飼，即將鼻飼管放入十二指腸，用牛奶等高營養流質持續點滴3至7天，以后可暫停鼻飼管，改用口服，如仍有嘔吐，可以再繼續鼻飼治療。
(四)腸神經官能癥
1、便秘
可予滑潤劑如石臘油、氧化鎂、安他樂和植物粘液性物質。
2、腹瀉
可用復方苯乙哌啶1-2片，每日2-3片，或0.25%奴夫卡因100-200毫升灌腸，一日一次。易蒙停1粒，每日2-3次。
三、中醫中藥治療
中藥按辨證。神經性嘔吐可用小半夏加茯苓湯加減。神經性噯氣用旋復代赭湯加減。情緒性腹瀉可選用止瀉藥方或附子理中湯合四神丸加減。
其它尚可采用針灸、理療等。