(1)房間隔繼發孔缺損的自然閉合率整體上為87%。在3各月以前診斷的缺損《3mm的房間隔缺損在1歲半內可100%的自然閉合;缺損在3~8mm的房間隔缺損在1歲半內有80%以上的可自然閉合;缺損在8mm以上者很少有自然閉合者。
(2)大多數房間隔缺損的兒童一般無癥狀，亦不影響活動，在嬰兒可出現心力衰竭，但非常少見。
(3)如果未經治療，充血性心力衰竭和肺動脈高壓將在成人的20或30歲左右發生。
(4)無論是否手術治療，房性心律失常(房撲或房顫)可在成人時出現。
(5)單純的房間隔缺損不會出現感染性心內膜炎，因此如果無其他合并畸形，不用預防性治療。
(6)腦血管意外，由于房間隔缺損引起成的矛盾性血栓造成的腦血管栓塞是比較少見的并發癥。