患黃疸型病毒性肝炎時，應與下列各病鑒別
(1)傳染性單核細胞增多癥
這些患者有發熱、咽峽炎、淺表淋巴結腫大、周圍血白細胞增高并有異形淋巴細胞(>10%)。血清嗜異凝集試驗陽性及EB病毒抗體免疫球蛋白M陽性等即可確診。
(2)鉤端螺旋體病
在流行區首先要除外此病。有疫水接觸史，高熱伴腓腸肌明顯疼痛、表淺淋巴結腫大、皮膚及粘膜出血傾向，腎臟損害，白細胞增加，尿中紅細胞、蛋白及管型陽性。如在血和尿中找到病原體，血清鉤端螺旋體凝集溶解試驗陽性等，即可與肝炎鑒別。
(3)藥物性肝炎
有服藥史，服用氯丙嗪、消炎痛、苯巴比妥類、磺胺類、對氨水楊酸、卡巴胂等，可致中毒性肝炎。此時胃腸道癥狀不明顯，黃疸出現之前無發熱，血清丙氨酸氨基轉移酶升高很明顯，但絮濁反應正常等可資鑒別。
(4)膽管結石
較多見于中年婦女，常有反復發作急性腹絞痛史，并放散至肩背部，黃疸與腹痛發作有關，呈間歇性。堿性磷酸酶、膽固醇、Y—谷氨酰轉肽酶等增高，膽道造影可有結石顯影。
(5)胰、膽腫瘤
老年人多見。胰頭癌起病緩慢，總膽管癌隱匿發病，患者消瘦明顯，上、中腹區痛持續加重，黃疸呈進行性加深。堿性磷酸酶、膽固醇及7—谷氨酰轉肽酶增高。B超、CT及磁共振檢查可探及腫物、膽囊腫大或膽管擴大等可明確診斷。
(6)其它
與肝膿瘍、回歸熱、敗血癥等均應注意鑒別。