黃體功能不全是指卵巢排卵后沒有完全形成黃體，以致孕激素分泌不足，使子宮內膜未能及時轉換，而不利于受精卵的著床。因此往往導致不孕或習慣性流產。黃體功能不全的機制目前尚不完全明確，醫學目前對其認識大致如此：
卵巢的正常功能
卵巢在不孕癥中有著十分重要的作用。卵巢的功能有兩種，一為產生卵子，包括卵泡發育，卵子成熟后排出。另一功能即分泌女性必需的激素以維持女性的第2性征，并作用于子宮等處，周期性的來月經。正常排卵周期分3個階段，即卵泡發育成熟、排卵、黃體形成。正常情況下，卵巢排卵前1-2天內，卵泡中的顆料細胞便開始黃素化，排卵后，黃素化形成黃體并分泌雌、孕激素。分泌量在排卵后7-8天達高峰，然后于月經前1-2天迅速下降。
卵巢功能異常導致黃體功能不全
如果垂體產生的促性腺激素及卵巢分泌的雌激素不足，卵泡發育成熟就不完善。雖然卵巢能排卵，但黃體正常發育要受影響，從而出現黃體功能不全。
內分泌失調導致卵巢功能異常
卵巢功能異常主要是由內分泌失調引起的，而導致內分泌失調的原因，既有內因又有外因。如過度緊張，抑郁，恐懼，環境突然改變，大病久病之后，以及營養不良等因素，影響了大腦皮層對內分泌的調節，或者多次宮腔手術使子宮內膜受傷，子宮內膜對女性激素的反應不靈敏，反射性地影響內分泌的調節，這些因素都會引發黃體功能不全。