肛瘺患者在明確診斷后，應盡早地到有正規肛腸專科醫生處接受手術治療，不要認為肛瘺會自愈或不會給自身帶來更大的痛苦。
為什么肛瘺一定要盡早治療?
近年來，臨床上時有報道肛瘺長期不愈而癌變，這可能是由于長期的慢性炎癥刺激而致使癌變。如果肛瘺癌變后，行手術治療一般很難保留肛門，而作腹部造瘺，給患者生活帶來不便，在心理上造成負擔。
大多數肛瘺開始時都是低位單純性的肛瘺，隨著病情的反復發作，膿腫的反復形成，不但經常腫脹疼痛，有膿液排出，污染內褲，給生活帶來不便，同時也會形成更多的支管，變成復雜性肛瘺，更值得重視的是還會向深部發展，形成高位肛瘺，給以后的手術帶來困難，手術時還可能損傷更多的肛門內、外括約肌，甚至肛管直腸環。
這樣的話，創面較大，患者痛苦亦大，不但創面愈合時間長，也可造成因肛門周圍功能肌的損傷而導致肛門功能下降，形成不同程度的肛門失禁。
由于肛瘺有反復腫痛潰膿的可能，特別是在身體疲乏時容易發生，膿水常污染內褲，肛門潮濕不適，進而可形成肛周濕疹等肛周皮膚病，增加患者的痛苦。因此，肛瘺患者應盡早進行手術治療。