腦血栓應盡早及時地治療，雖然不及腦出血兇險，但是病人大多年老體弱，諸多慢性病纏身，在治療上有許多謹慎用藥的情況，加之梗塞區可以在短時間內擴大，還會發生許多合并癥，所以腦血栓的死亡率也是比較高的，而且殘廢率高于腦出血。
腦血栓治療原則主要是改善腦循環，防治腦水腫，治療合并癥。適當地活動可以起到改善腦循環的作用，但有神志不清的應臥床休息，加強護理。
改善腦部血循環
增加腦血流量，促進側支循環建立，以圖縮小梗塞面積。選用低分子右旋糖酐、706代血漿、川芎嗪等藥，每日1～2次，靜滴液量250～500毫升，連用7～10天。有頭痛、惡心、嘔吐或意識障礙者，可用20%甘露醇脫水治療，每日2次，每次250毫升。
溶血栓療法
也有人采用尿激酶頸動脈給藥治療腦血栓，一般在發病24小時之內應用，由于采用頸動脈穿刺注藥，難度較大，必須在醫院應用。溶栓治療應早期應用的原因，是由于血栓形成的第1天內，富含水分，易溶解，這樣見效快，療程短，但要密切觀察病情，以免引起腦出血的嚴重后果。
高壓氧治療
經實踐證明高壓氧治療對腦血栓效果很好，可以大大降低腦血栓的病殘率。宜于早期應用，每日一次，10次為1療程，每次吸氧時間90～110分鐘，必須在密閉加壓艙進行，受條件限制。
調節血壓，控制高血脂，高血糖
目的是控制發病的危險因素。但血壓過高的不要降壓太快;血壓過低時適當給予提高。腦血栓病人往往血糖高，對治療不利，必須積極控制。
昏迷病人注意保持呼吸道通暢
及時吸痰，翻身拍背，活動肢體，預防肺炎和褥瘡發生。