醫門補要·醫法補要·痔瘡》中說：“濕熱下注大腸，從肛門先發小疙瘩，漸大潰膿，內通大腸，日久難斂;或愈月余又潰，每見由此成癆者。乘初起，服清熱內消散，數帖可愈。若先咳嗽而成漏者，不治”?？梢姳静〉陌l生，為肛門直腸周圍癰疽潰后久不收口，濕熱余毒未盡，蘊結不散，血行不暢所致;或因脾肺腎三陰虧損，或因肛裂損傷感染而生。正如《諸病源候論·瘺病諸侯》中所說：“但瘺病之生，或因寒暑不調，故血氣壅結所作，或由飲食乖節，狼鼠之精，入于府藏，毒流經脈，變化而生，皆能使血脈結聚，寒熱相交，久則成膿而潰漏也?！?/p>

　　現代醫學認為，肛管直腸周圍膿腫，自然破潰，或經手術切開排膿后，膿腔壁由結締組織和肉芽組織增生，縮窄成管狀，外口縮小，內口繼續感染，不能自愈，即成肛瘺。膿腫破潰或切開引流后，不能治愈，有以下幾種原因：

　　一、內口的存在，膿腫雖然破潰或切開引流，但原發感染源、肛竇炎或肛腺感染仍可繼續存在，腸腔內容物也可從內口繼續進入瘺管。

　　二、肛門部不能靜養，膿腔不易粘合。排糞排尿運動時，因括約肌收縮或因炎癥刺激肛門括約肌，使肛門括約肌經常處于痙攣狀態。

　　三、腸腔中的糞便腸液和氣體繼續進入瘺管，刺激管壁，使管壁結締組織增生變厚，管腔難以塌陷閉合。

　　四、膿腔引流不暢，或外口縮小，時閉時潰，膿液蓄積腔內導致膿腫再發，并穿破而形成新的支管或竇道。

　　五、管道多在不同高度穿過肛門括約肌，括約肌收縮阻礙膿液排出，以致引流不暢。

　　除此而外，結核、克隆氏病、潰瘍性結腸炎、肛管或者腸癌和腹股溝淋巴肉芽腫等，也是形成肛瘺的病因。

　　肛瘺一般由內口、瘺管和外口三部分組成。內口為原發性，是感染源的入口，絕大多數在肛管后側齒線平面的肛竇內。瘺管或直或彎，有的分枝甚廣，在括約肌各部之間和肛門周圍皮下蔓延;或由一側圍繞肛管到對側，形成蹄鐵形肛瘺。外口是膿腫潰破或切口所在部位，多在肛門周圍皮膚上，常不止一個外口，多數在距離肛門5厘米以內。如膿腫在原發病灶內口處向腸腔內潰破，則無繼發外口，只有一個內口，通向肛管的竇道，稱為單口內瘺。竇道一般不長，在臨床上很容易被忽視。

　　通過病理組織切片顯微鏡檢查發現，一般肛瘺內壁由非特異性炎性肉芽組織構成，壁外層有大量纖維組織，急性感染時有較多的中性白細胞浸潤。由于瘺管直接與直腸肛管相通，糞便可經常進入瘺管內，以致瘺管組織往往有多核異物巨細胞反應和較多的單核細胞出現，有時可見較多嗜酸性細胞浸潤?；冀Y核性肛瘺時，在其管壁內可見到多少不一的、由類上皮細胞、淋巴細胞和郎罕氏巨細胞構成的結核性肉芽組織，有時還出現干酪樣壞死。

　　瘺管組織由異物反應所形成的異物性肉芽腫，要與結核性肛管瘺相鑒別。在異物性肉芽腫中，異物性多核巨細胞的內外，往往可見異物存在，單核細胞散在，不單獨組成結節狀，不出現干酪樣壞死。這些表現均與結核性肛瘺不同，是鑒別的重要依據。